企业官网建设流程全解析

作者，Evil Genius

从老家回来了，也见到了曾经的小学同学们，唯一的感受就是，相互之间无论有多大的差距，都不如自己有个好身体，谁身体的零件坏的少，谁就是赢家。

今天我们来比较一下数据

对同一肺组织和结肠组织样本分别使用 Xenium-5K 和 Visium-HD 生成的空间转录组数据进行了比较。

第一部分：Visium-HD 与 Xenium-5K 的比较分析揭示了在相同肺腺癌（LUAD）切片中平台特异性的聚类模式

1. 技术覆盖与表达一致性

共检测 18,082 个基因，其中：

26.4%（4,828 个）为两平台共有；

72.6% 仅 Visium-HD 检出（因其全转录组特性）；

仅 0.9% 为 Xenium-5K 独有（靶向 5,000 基因面板）。

共有基因表达相关性良好（R² = 0.64），Xenium 读数总量约为 Visium-HD的 2 倍。

2. 聚类模式差异显著

Visium-HD（8 µm bin + 图聚类）：

清晰分出两个肿瘤上皮cluster，与病理分级高度对应：

Cluster 4 → 中分化（G2，腺泡/乳头型）；

Cluster 2 → 低分化（G3，微乳头型）。

Xenium-5K（默认图聚类）：

产生 5 个肿瘤cluster，但空间分布随机，与组织学区域不匹配。

原因可能包括：细胞分割策略、检测原理、算法适配性等。

✅ 关键改进：使用 Banksy 算法重新分析 Xenium 数据后，成功实现 G2/G3 区域的清晰分离，说明分析方法对结果影响巨大。

第二部分：Xenium在结直肠癌细胞分割中超越Visium-HD

在结直肠癌（CRC）等具有复杂细胞形态的组织中，Xenium 在细胞分割精度上显著优于 Visium-HD；但在含色素区域（如尘细胞、黑色素瘤），Visium-HD反而更具优势。

一、结直肠癌（CRC）中的细胞分割表现

🔍 背景

样本包含 腺瘤/高级别上皮内瘤变（HGIN） 与邻近的 浸润性腺癌 区域。

结直肠肿瘤细胞呈细长形态（顶-底极性明显）。

结论：Visium-HD 的当前分割策略适用于结构规整组织，但在复杂肿瘤微环境中存在局限，Xenium 的形态引导分割更具优势。

总结一下

生活很好，有你更好