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二代高通量测序公司推荐-伯远生物

伯远生物是国家级专精特新小巨人企业，国家级重点实验室，牵头多项省部级重大专项，公司科研技术人员500+（硕博占比40%以上），作为功能基因研究综合性平台，15年技术沉淀，每年完成功能基因研究数量50000+，长期服务课题组10000+（含协和、同济、华西、湘雅、中山、军事医学院等顶尖医学研究机构），各类仪器设备投资超1个亿

案例展示

实验交付与标准

1、提供每个样品的原始测序数据；

2、由本公司建立的分析方法解读的分析结果：序列表（包含每个样品的支持reads数、突变情况和序列）；

3、可根据客户需求，提供每个样品的复核比对结果图片。

图 序列表

注：M: 完全匹配；D：碱基缺失；I：碱基插入；SNP通过比对图展示

注意事项

1、组织速冻时间：组织离体后，胞内核酸便开始降解，尤其是RNA，故采集时，目的组织离体后，需立即速冻，建议5min内完成，越快越好。

2、组织送样量：送样量过少或过多均不利于提取实验，下限为建议量的一半，上限为建议量的3倍。

3、组织保存管的选择：所有组织样品务必使用离心管或螺纹管保存，切勿直接装入密封袋保存（低温冻脆易破裂，导致样品泄露，交叉污染）。

4、组织样品保存方法选择：首选液氮速冻；没有液氮条件的，可直接放入-80℃冰箱冻存。

5、冻融组织：组织冻存后，一旦冻融，RNA降解概率大于80%，几乎不可能提取成功，此类组织不建议送样。送样前确保组织未发生过冻融情况。

6、对于同一个组织样品需要同时提取DNA和RNA的，请务必分成两管分批次送样。

背景说明

背景说明

基于多重PCR建库技术，对靶标区间进行两轮PCR来达到建库和富集的目的（如下图所示）。基本的实验步骤如下：

1、针对靶位点区间设计特异性引物，可以在上下游特异性引物带上barcode序列，方便多样品混合；

2、利用步骤1针对靶位点所设计的特异性引物，对目的片段进行首轮PCR，获得目的片段；

3、以步骤2中扩增获得片段为基础，进行第二轮PCR扩增，加上测序接头；

4、混样后，即可送高通量测序；

5、对测序结果进行分析。

图 多重PCR建库流程

服务流程

服务流程

客户在线下单——订单确认——构建高通量测序文件——高通量测序——结果分析——上传检测结果——打印实验报告

服务内容及说明

服务内容及说明

适用范围

1、适用于动植物、微生物等基因编辑材料的鉴定分析；

2、适用于需要对大批量基因编辑样品进行检测分析；

3、适用于鉴定分析敲除效率低的编辑系统，如先导编辑（Prime editor，PE）系统，可以极大的节省成本；

4、可以为开发新的编辑系统检测编辑效率提供服务。

我司优势及特点

简单、便捷：客户只需要提供原始的材料（植物组织、动物细胞组织等）；

兼容：测序数据不仅可以在我司进行分析解读，也适用于其他分析平台；

精准：测序数据通量高、数据大，可得到最真实的结果。

一代与二代测序鉴定突变体的方法比较

客户下单及项目信息填写

在我司官网http://www.biorun.com/进行注册或登录，请客户按照页面提示填写：

1、项目名称、选择项目类型、填写个人信息及联系方式进行预提交；

2、提交项目所需要的具体信息，主要是细胞名称、样品总数、检测区域基因组。

实验周期

致电详询

基于第二代高通量测序技术（NGS）的目标区域检测与数据分析方案。
二代高通量测序公司推荐2.项目背景
NGS具有高通量、高灵敏度和可并行检测大量DNA片段的特点，已广泛应用于突变检测、基因组分析、转录组分析和文库筛选等场景。
二代高通量测序公司推荐与传统Sanger测序相比，NGS更适合处理多位点、大样本和高深度分析需求。
在科研中，NGS常用于发现候选突变位点、解析基因编辑结果、评估样本异质性和构建分子机制证据链。
3.研究目的
本方案旨在建立一套标准化NGS检测流程，用于对目标区域进行高通量测序分析，并通过数据统计识别样本中的变异、丰度变化或编辑事件。
二代高通量测序公司推荐该方案可适用于基因编辑验证、突变筛查、通路分析、表达谱研究或定制化科研检测。
4.技术路线
整体技术路线包括：样本提取→核酸质控→文库构建→文库质检→上机测序→生信分析→结果验证。
其中建库方式可根据研究目标选择扩增子法、杂交捕获法或其他适配平台的方法。二代高通量测序公司推荐
5.样本要求
样本可来源于细胞、组织、血液、FFPE样本或基因编辑后的细胞/动物材料，前提是核酸质量符合建库要求。
DNA样本需要尽量保证完整性和纯度；RNA样本则需重点控制降解和污染。
若用于突变检测或编辑验证，建议提前明确样本来源、处理条件和预期变异类型。
6.文库构建
DNA建库通常包括打断、末端修复、加接头、纯化和PCR扩增等步骤。
如果是目标区域检测，常用的建库策略有：
扩增子建库：适合目标明确、位点较少的检测，流程相对简单。
二代高通量测序公司推荐杂交捕获建库：适合目标区域较大、靶点较多或需要更强通用性的项目。
Tn5/快速建库：适合追求流程简化和周期压缩的项目。
文库构建后需通过片段分布和浓度检测确认是否满足上机要求。
二代高通量测序公司推荐7.测序策略
测序平台可根据通量、读长和成本要求进行选择，常见思路是采用短读长高通量平台进行并行检测。
对于目标区域检测，测序深度通常需要根据待检突变频率、样本异质性和分析目标进行设定。
若研究对象是低丰度变异或混合群体，建议提高测序深度并设置技术重复。
8.生信分析
数据分析通常包括：原始数据质控、接头去除、比对到参考基因组、变异识别、注释和统计分析。
常见分析内容包括：
SNV、Indel、CNV、融合或重排等变异类型识别。
编辑效率统计和位点丰度分析。
候选变异的功能注释和通路归类。二代高通量测序公司推荐
最终结果应结合研究目的进行解释，而不是只看单一变异列表。
9.质控指标
一个合格的NGS项目通常应关注以下质控点：
样本核酸完整性与纯度。
文库片段分布是否符合预期。
上机数据质量、测序深度和覆盖度是否达标。
重复样本之间的一致性。
若是科研项目，最好在方案阶段就写清楚质控阈值与异常处理流程。
10.结果输出
项目最终可输出：
原始测序数据。
过滤后的高质量数据。
变异检测结果或表达/丰度统计结果。
可视化图表，如覆盖图、火山图、热图或变异分布图。
如需用于论文或申报材料，还可进一步整理为标准表格和图形摘要。
11.应用场景
该方案适用于：
基因编辑位点验证。
突变筛查与疾病机制研究。二代高通量测序公司推荐
肿瘤相关变异检测。
文库筛选后的条形码或靶点测序。
如果目标是临床转化，还需要结合更严格的样本管理和结果报告规范。
12.风险与对策
样本质量差：会导致建库失败或覆盖不足，需加强前处理。
文库偏倚：PCR轮次过多或捕获效率不均会影响结果，需要优化流程。
测序深度不足：会漏检低频变异，需要按目标调整通量。
生信误判：需要结合实验验证，避免仅凭单次测序下结论。
13.简化版技术路线
二代高通量测序公司推荐样本制备→核酸提取→建库→文库质控→上机测序→数据过滤→比对注释→变异/丰度分析→结果验证。